Deoxyribóza je 5-uhlíkový monosacharid (pentóza), ktorý vzniká z ribózy, keď stratí jeden atóm kyslíka. Empirický chemický vzorec pre deoxyribózu je C5H10O4 a kvôli strate atóm kyslíka, nesúhlasí so všeobecným vzorcom pre monosacharidy (CH2O) , kde n je celé číslo.
Fyzikálne a chemické vlastnosti
Lineárny vzorec pre deoxyribózu možno znázorniť takto: H-(C=O)–(CH2)–(CHOH)3-H. Existuje však aj vo forme uzavretého kruhu atómov uhlíka.
Deoxyribóza je bezfarebná tuhá látka, ktorá je bez zápachu a je vysoko rozpustná vo vode. Jeho molekulová hmotnosť je 134,13 g/mol, bod topenia 91 °C. Získava sa z ribóza-5-fosfátu pôsobením vhodných enzýmov počas redukčnej chemickej reakcie.
Rozdiel medzi ribózou a deoxyribózou
Ako už bolo spomenuté a ako už názov napovedá, deoxyribóza je chemická zlúčenina, ktorej atómové zloženie sa od ribózy líši len o jeden atóm kyslíka. Ako je znázornenéna obrázku nižšie deoxyribóza nemá na svojom druhom atóme uhlíka hydroxylovú skupinu OH.
Deoxyribóza je súčasťou reťazca DNA (kyselina deoxyribonukleová), zatiaľ čo ribóza je súčasťou reťazca RNA (kyselina ribonukleová).
Je zaujímavé poznamenať, že monosacharidy arabinóza a ribóza sú stereoizoméry, to znamená, že sa líšia priestorovým usporiadaním vzhľadom na rovinu kruhu skupiny OH v blízkosti 2. atómu uhlíka. Deoxyarabinóza a deoxyribóza sú rovnaké zlúčeniny, ale používa sa druhý názov, pretože táto molekula je odvodená od ribózy.
Deoxyribóza a genetické informácie
Pretože deoxyribóza je súčasťou reťazca DNA, hrá dôležitú biologickú úlohu. DNA – zdroj genetickej informácie, pozostáva z nukleotidov, medzi ktoré patrí deoxyribóza. Molekuly deoxyribózy spájajú jeden nukleotid s druhým v reťazci DNA prostredníctvom fosfátových skupín.
Zistilo sa, že absencia hydroxyl OH skupiny v deoxyribóze poskytuje mechanickú flexibilitu celému reťazcu DNA v porovnaní s RNA, čo následne umožňuje molekule DNA vytvoriť dvojvlákno a byť v kompaktnej forme vo vnútri bunkové jadro.
Okrem toho, vďaka flexibilite väzieb medzi nukleotidmi tvorenými molekulami deoxyribózy a fosfátovými skupinami je reťazec DNA oveľa dlhší ako RNA. Táto skutočnosť umožňuje zakódovať genetickú informáciu s vysokou hustotou.
